在北卡的乔·约翰斯顿将军(General Joe Johnston)的军队,在李将军投降5天后,也要与北军谢尔曼将军谈投降的事了。1865年4月26日,约翰斯顿将军的军队投降。接下来,一批批军队陆续投降。但有些南军士兵并不想投降,还想与北军继续作战。 约翰逊没有领会林肯生前的意愿,让邦联总统杰佛逊·戴维斯(Jefferson Davis)逃亡国外,因为林肯认为这样对南方重建更有好处。约翰逊抓捕了戴维斯,关了十几个月,最后在1867年,释放了他。 5月下旬,15万士兵在华盛顿举行了盛大的游行,庆祝胜利。四年的内战结束了。但南北双方都付出了惨重的代价:南北双方战争开支几乎都是35亿美元,而战争多在南方展开,因此南方遭到了更多的破坏与损失。南方几乎无力重建,而华盛顿的激进派共和党还主张严厉惩罚南方。约翰逊是南方人,他想用自己的计划重建南方。