1922年10月蒙古人民党政府发布了对丹毕的判决书:“政府认为,必须采取措施,将人民的敌人,阴险狡猾、罪恶多端的丹毕坚赞迅速捉拿归案。军事法庭已经将他判处死刑。”1923年初,苏联和蒙古国派出了几批特工去寻找丹毕,内务部长巴勒丹道尔吉率领由蒙苏特工组成的别动队前往马鬃山执行剿匪任务。特工化装成喇嘛并伪装成哲布尊丹巴呼图克图的使团抵达丹毕城堡,对其进行了暗杀,蒙古军人南兹德巴特尔砍下了丹毕的首级,用福尔马林进行防腐处理后送往乌兰巴托,悬挂在广场上示众,最后带回苏联。目前,丹毕的首级保存于圣彼得堡俄罗斯国立人类学民族学博物馆艺术间展示馆,编号3394号。