甲三的死或多或少都与和袁甲三所属政治阵营与曾国藩湘军政治阵营的斗争有关。 受1861年寿州失陷事件牵连,袁甲三与当时的安徽巡抚翁同书被曾国藩参奏免职。据说这份奏折,是由当时给曾国藩当幕僚的李鸿章起草的。翁同书是光绪帝老师翁同龢的哥哥。因为这份奏折,翁同龢的父亲翁心存及翁同书先后忧愤而死。翁同龢之后与曾国藩、李鸿章一直相争,这个事件是个死结。