合金弹头3是合金弹头系列的第4部,也是最后一部以SNK名义制作发行的作品,也是被认为系列中素质最高的一部,游戏方式仍然继承自之前的合金弹头系列作品,但首次出现了分支路线的设定:除了最后一关,前四关均可以有多种不同路线可供选择,每条路线的场景和敌人均不同,但最后面对的BOSS是一样的。游戏共有五关,但最后一关路线特别长,因此总体流程长度依然和之前几代相差无几。