玄妙观原址位于国家历史文化名城河南省次中心城市南阳市古宛城西北隅之梅溪河畔,即今南阳市建设中路北侧,与市人民公园北门隔马路相望。现为宛城区人民政府驻地。 。现在,市区的玄妙观大部分建筑已毁坏,仅余三清殿,玉皇殿,藏经阁,大斋堂了,其它碑刻,文物已星散各处。新址位于南阳市卧龙区靖宇路独山玉国家矿山公园独山风景区南阳独山道观曾为玄妙观的分院,现在已逐步恢复,不过已感受不出古老道观厚重的文化与韵致。