本剧集自第三季起分为播出顺序和剧本顺序(故事线顺序),本系列视频采用的是剧本顺序,所以第三季是26集,回目顺序也跟IMDB的信息有出入,但是故事线更加合理。第三季也是全剧的精华所在,包括了《凤凰传说》和《黑凤凰》两大章节及其衍生剧情。x战警的大后盾莉兰德拉及其代表的希阿势力也正式出场,并在以后的情节里左右着x战警的命运。