孙燧作为江西巡抚,面对宁王之乱,从各方面开始积极行动,抑制宁王朱宸濠各种谋反的举措。公元1519年6月14号,江西所有的官员都来给宁王拜寿,宁王朱宸濠说当今皇帝朱厚照非孝宗皇帝亲子,现太后令他起兵监国,讨伐伪帝朱厚照,问孙燧以及江西官员是否听话保驾。孙燧拍案而起,破口大骂朱宸濠是乱臣贼子,人人得而诛之。朱宸濠大怒,命人把孙燧当场绑了,折断两臂,当即斩首。