横琴客运码头也称“横琴码头”,位于横琴新区红旗村环岛东路,2018年重新复航,已开通“横琴-东澳”航班,珠澳海上游航班。除特殊天气等情况,每日有3个固定航班往返横琴与东澳岛,旅游旺季5月至10月每日固定航班9班,珠海市户籍居民乘船将享受8折优惠。