曼达洛人第二季的故事承接了曼达洛人第一季,主要讲述丁贾林与格洛古(小尤达)一同在银河系内冒险,等待他们的将是更加危险的敌人。他们在塔图因和塔斯肯袭击者合作,向恐怖的克雷特龙发起挑战,又邂逅了博-卡坦·克里兹一行人,在和克里兹的交流中,得知了绝地武士阿索卡的踪迹。小尤达被帝国残余势力绑架,丁贾林和波巴·费特联合,准备潜入帝国的基地救出小尤达。