孜珠寺位于西藏东部著名的神山——孜珠山上,海拔4800米左右。其始建于三千年前,由二代藏王穆赤赞普倡导,是雍仲苯教最古老的寺庙之一。“孜珠”意为“六座山峰”,象征着观音菩萨度化六道众生。而孜珠山为苯教四大神山之一,另外三座分别是:阿里的冈底斯山、林芝的苯日神山、德钦的梅里雪山。