本次的故事中,玩家将扮演一名住在寂静岭附近的中型城市灰原市南部(South Ashfield)的男性亨利·汤森德,当主角从恶梦中惊醒时,发现自己被锁在居住了两年的公寓里面。此时不但窗户无法打开、打破,就连墙壁也都无法打碎,连电话也都完全无法使用,即使大喊大叫也没人能听见他的求救…而门口也被数条巨大的锁给锁了起来。为了脱困,主角深入突然出现在浴室里的洞穴内,并在各式各样的异世界中穿行,与十一种的怪物、十一种怨灵对抗。而如何解开自己房间与充满怪物、怨灵的异世界之间的奇异联系的谜题,便是玩家在游戏中最重要的主题之一。