新疆南北两疆的区别主要在于地理环境、气候、历史、文化和经济发展。北疆位于天山以北，地貌多样，气候干旱，以游牧文化为主，经济发展依赖资源开发。南疆位于天山以南，地势西高东低，气候干旱，维吾尔族文化浓厚，经济以农业和服务业为主。