当被称为怪兽的外星怪物从海中势不可挡地冒出来时,它们带来的,是一场夺取百万生命和人类资源的战争。接连摧毁旧金山、马尼拉和墨西哥等城市后,怪兽数量与攻击次数越来越多。为了对抗怪兽的袭击,人类启动代号“机甲猎人”(Jaeger)的作战计划,亦即以“巨大神经元合体机械人”为地球设下防卫机制。