电影《神盾局特工》主要讲述了神盾局请出已经退休的尼克·弗瑞重新出马,阻止由斯特拉克男爵的女儿蛇神夫人发动的危机。蛇神夫人偷了某种大规模杀伤性武器,对全城构成了严重威胁,因此尼克·弗瑞被召回以应对这一紧急状况。