马耳他骑士团起源于1099年,最初是在中东耶路撒冷的圣约翰洗者教堂附近的医院里成立,又称医院骑士团,其成立的主要目的是照料伤员和到耶路撒冷的宗教朝圣者,后来发展迅速,从1110年起,获得了耶路撒冷的一部分土地和财产,并在1113年获得了教廷的承认,并赐予一定的经济、政治特权,从此马耳他(医院)骑士团和圣殿骑士团、条顿骑士团并称为三大骑士团。