泰国本身国内因素也遏制了克拉运河计划的执行。泰国的东西两岸被马来半岛隔开了,一直以来都不太安稳,在一战二战期间虽然没有被殖民,但日本帝国主义在东南亚的肆虐,也影响了泰国的政局,使得南部主要以伊斯兰人口为主,北部围绕着中央以泰族人为主。南部居民不满当局的统治,频繁发起脱泰分离运动。