为了保护长门的遗体,小南将阿飞引入大海中小南事先对阿飞的忍术进行了深入的研究,做了充分的准备,小南发动了神之纸者之术,使阿飞陷入自己事先准备好的六千亿张起爆符中,准备将阿飞炸死。阿飞准备将自己吸收至异空间逃脱,但由于吸收时身体必须实体化,而且吸收自身的速度比较慢,同时小南迅速在阿飞身上贴上起爆符引爆,阿飞不得已只好放弃吸收转为虚体化躲过爆炸,但又想到单眼神威虚化只可维持五分钟左右,而小南的六千亿张起爆符可爆炸达十分钟,阿飞迫不得已只好动用移植来的写轮眼,发动宇智波一族的禁术——伊邪那岐,将所有爆炸变为虚幻。在小南以为阿飞已死之时,阿飞突然从背后出现并用废弃的铁管重伤了小南,小南凭仅剩的查克拉奋力攻击阿飞,结果完全不敌,被阿飞抓住脖子并对奄奄一息的小南发动幻术,得知了长门尸体所在,成功夺取了轮回眼,而小南则香消玉殒。小南临死前回忆起了小时候三个人和自来也老师一同生活的往事,最后带着微笑死去。