石河子站站房的设计理念从“军垦第一犁”入手,对“军垦第一犁”的兵团精神形象进行了抽象化处理。设计中通过采用直线与斜线的对比,加强石河子站站房的建筑动感;通过对称的立面造型达到均衡,主材以浅红色花岗岩为主,配以LOW-E玻璃幕墙,充分体现了建筑的现代特色。立面分割线条强调现代感;整齐、严密的拼贴强调建筑的逻辑关系 。 截至2012年3月,石河子站站房总建筑面积为10260平方米,设计日最高聚集人数为2500人次。石河子站站房建筑总高度21.8米(另:架空层高4.95米)。石河子站基本站台宽度为12米,长度为500米;基本站台风雨棚净高12.5米,总长450.0米,跨度为21.95米;基本站台无站台柱风雨棚水平投影面积为10050平方米。跨线天桥宽度为8.0米(净宽度),天桥桥面标高为8.00米。