活佛转世制度由于得到明清两朝鼎力支持、宣传和推崇而达到巅峰,但也弊端百出。乾隆时期,活佛在西藏的认定过程中出现了舞弊现象,一些大贵族与护法神串通作弊,甚至一些大贵族垄断认定程序,导致多个大活佛同出一个家族的怪现象。