亚东县位于西藏自治区南部边境、日喀则地区东南部,东经88°52′-89°30′、北纬27°23′-28°18′。北与康马、白朗、岗巴三县相接,东邻不丹,西毗中印边境锡金段,南倚中、印、不三国交界的吉姆马珍雪山,是连接西藏腹地与不丹、印度锡金邦的主要通道,自古战略地位极其重要。全县东西宽45千米,南北长123千米,总面积4306平方千米。