博物馆由福建省援建的,一楼为综合展厅,主要展出:昌吉州党史、书画、摄影、剪纸、奇石和根雕等作品,二楼为《回族民俗展览》,三楼为《庭州历史文物展》。现共有各类馆藏文物2800多件,其中有国家珍贵文物近百件,这些文物真实反映了这个州新石器时代至清代的悠久历史文化,是新疆爱国主义教育基地。