杭州东站分五层结构,地上2层,地下3层。其中地上一层为火车站台层;地上二层为高架出发层,由3条双向4车道的城市高架组成,可以实现车辆在东、西广场、站房的互通;地下一层为出站层(出站大厅),旅客可以在此直接坐出租车出站;地下二、三层分别是地铁1号线与4号线的进站层和站台层,乘客可以在车站中部直接下去坐地铁离开。 杭州东站的功能性设计非常便捷,铁路枢纽车站都修建的非常大,多数是在车站的两端上进下出。杭州东罕见的设计在车站中部进出,旅客进出站十分便捷,建筑风格又很惊艳。杭州东站华而实用,杭州创新崛起之城,名副其实。