六月十一日,清兵进抵塘西。总兵方国安和侄儿方元科所部兵马还有一万左右,准备拥立潞王保卫杭州。没想到朱常淓决意降清,在方军同清军战于湧金门下时,朱常淓竟把酒食送下城墙犒劳清军。方元科等极为愤慨,东渡钱塘江,后来参加拥立鲁监国的行列。六月十四日,清军占领杭州。七月,满洲兵难以忍受江南暑热,班师回朝,同时将弘光帝和潞王、惠王、周、崇等藩带回北京。途中,朱由崧的嫡母邹太后跳入淮河自尽。朱常淓被清军挟至北京后,于顺治二年十一月上疏清廷“恭谢天恩”。次年五月,朱由崧、朱常淓以及其他降清的明朝藩王都在北京被杀。整个弘光朝廷就在这种耻辱的状况下结束了。