房屋未登记部分的面积，可以依据情况申请认定为合法建筑

国有土地上房屋征收补偿条例 第二十四条　　　市、县级人民政府作出房屋征收决定前，应当组织有关部门依法对征收范围内未经登记的建筑进行调查、认定和处理。对认定为合法建筑和未超过批准期限的临时建筑的，应当给予补偿；对认定为违法建筑和超过批准期限的临时建筑的，不予补偿。