过去认为尿道下裂的发病率为千分之二到四，也就是说每300个男孩当中有一个患儿患有先天性的尿道下裂，近年来尿道下裂的发病率不断增高。尤其是重度的尿道下裂，全球各个地区的发病率有所不同，报道不一，欧洲的为万分之19.9，亚洲的为万分之5.2，北美的为万分之34.2，南美的为万分之5.
