一般来说,儿童扁桃体发炎大部分是由于细菌的感染或者早期有病毒感染、后期合并有细菌感染。临床上会使用抗生素进行治疗,首选使用头孢类的抗生素或者青霉素类的抗生素。另外,部分患儿是由于上呼吸道感染误诊为扁桃体发炎。一般可以检查血常规来查明感染原因,并使用相应的抗生素治疗。