CT引导下经皮穿刺肺活检术主要的并发症为咯血和气胸。气胸更为常见,通常情况下大部分的气胸不用处理自己可以吸收。如果气胸较大,则可以放置引流管来使气胸愈合吸收。另外,空气栓塞是最严重的并发症,它会导致患者死亡,发生率大概在1‰到2‰。因此,一定要注意避免这种情况的发生。