输尿管镜碎石术的并发症分为短期和长期的并发症。短期的并发症主要是发生输尿管损伤,如果患者输尿管狭窄,内镜微创治疗,但要是处理不好也会造成损伤,比如输尿管粘膜下隧道拉伤或撕裂,甚至输尿管壁整个拉断;还会引起穿孔;更有术后出现血尿进而引起发热等。