孕囊出血的原因一般包括:1、由于孕囊发育出现问题导致孕囊发育出点问题而出现出血情况。2、宫内妊娠和宫外妊娠同时存在,也会造成孕囊出血。3、胚胎本身发育不佳,也会造成孕囊出血。4、当为双胎妊娠时,其中一个胚胎发育不好,也会造成孕囊出血。