手足口病为传染病,主要由于肠病毒中的柯萨奇病毒及EV71型肠病毒等引致,并经由口、鼻、喉分泌物或水泡液体传染。其麻烦之处在于即使患者已经完全康复,病毒仍会残留于患者粪便,当接触到受病毒污染之物品,即有机会再受感染或传染。