
【0716新课发布】Top9.7分,网络毒理学+单细胞(手动)+分亚型+细胞通讯+双虚拟(过表达、敲除)+空间转录组+Shap分析+机器学习+分子对接 01.思路介绍 02.PubChem查找化合物结构 03.CHEMBL数据库中检索化合物的潜在靶点 04.PharmMapper 05.Similarity Ensemble Approach(SEA) 06.数据库中相关的靶点取并集 07.GEO批量转录组数据下载-第一个数据 08..转录组数据整理-第一个数据集 09..添加样本类型信息-第一个数据集 10..转录组数据下载-第二个数据集 11..转录组数据整理-第二个数据集 12.添加样本类型信息-第二个数据集 13.两数据集合并并去除批次 14.差异分析-合并数据-训练集 15.WGCNA分析 16WGCNA模块基因、差异基因、化合物预测基因取交集 17.交集基因的富集分析 18.GEO批量转录组数据下载-测试集1 19..转录组数据整理-测试集1 20.添加样本类型信息-测试集1 21..转录组数据下载-测试集2 22.转录组数据整理-测试集2 23.添加样本类型信息-测试集2 24.组合机器学习构建模型 25.模型的综合分析 26.诊断模型的基因在火山图分布 27.shap分析 28.免疫浸润评分 29.免疫浸润可视化分析 30.蛋白和药物小分子数据下载 31.分子对接 32.Discovery Studio软件绘制蛋白-配体相互作用 33.分子对接结合能热图 34.单细胞数据下载 35.单细胞数据整理 36.单细胞数据分析-手动 37.诊断模型基因在细胞的分布 38.虚拟敲除分析 39.虚拟过表达分析 40.细胞通讯分析 41.观察值期望值比值(Roe) 42.研究亚型细胞的提取 43.亚型细胞的手动注释 44.亚型细胞的ROE 45.模型基因在亚型细胞的分布 46.通路评分在细胞的分布情况 47.空间转录组数据下载 48.空间转录组分析